Сред акцентите в тях са Средновековен град Червен и Ивановските скални църкви, най-важните елементи от археологията на Русе и последните разкопки, както и темата за Русе и войните.
Залите са оборудвани със специални мултимедийни кътове, където могат да се видят филми, изработени по сценарий за конкретните теми от експозицията. Има и интерактивни маси, които разказват за Русе през вековете и впечатляващи сгради.
Посетителите могат да видят оригинали от средновековните стенописи в част от Ивановските скални църкви, които не са отворени за посещение, както и църковна утвар от периода 16-19 век, предоставена от Русенската митрополия.
Общо са обновени седем зали, като две от тях – за Червен и църквите, са съвсем нови, а в останалите пет сме развили по нов начин разказа, за да подчертаем значението на Дунавския лимес, който е бил границата на Римската империя, каза директорът на музей доц. Николай Ненов.
Обновлението на музея е реализирано по проект с европейски средства, подчерта при откриването кметът на Русе Пламен Стоилов.