По думите на говорителя на Окръжна прокуратура в лудогорския град Милена Пенчик, срещу него се води наказателно производство за изготвяне от длъжностно лице на документ с невярно съдържание. Божков се явявал подстрекател, а извършител на престъплението е друг полицейски служител с по-нисък ранг, който също е разследван. Разследването е започнало в началото на декември 2013 г., но обвинения все още не са повдигнати.
Според неофициална информация сигналите срещу бившия шеф на „Охранителна полиция“ са повече от един, проверка е извършвала и „Вътрешна сигурност“. Образувано е дисциплинарно производство, завършило с разжалване на комисаря миналата седмица. Началническият пост временно се изпълнява от Синан Тахсинов, а Божидар Божков е с ранг инспектор КОС.