Това се случи по време на 12-ия извънреден конгрес на централата, който се проведе в гръцката столица Атина. Той ще заема президентския пост до 2019 година, наследявайки Мишел Платини. Французинът не успя да завърши своя мандат, след като бе отстранен заради обвинения, че е получил незаконно превод на стойност 2 милиона франка от бившия президент на ФИФА Сеп Блатер. 48-годишният Чеферин се пребори в конкуренцията на холандеца Михаел ван Прааг. Словенецът спечели с огромно мнозинство, след като за него гласуваха 42-ма от общо 55-та делегати на европейските футболни федерации.